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医疗行业非结构化数据混合云存储及大数据分析解决方案

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医疗行业非结构化数据混合云存储及大数据分析解决方案

 

 “存储架构之美”软件定义存储擂台赛优秀解决方案

  医疗行业非结构化数据混合云存储及大数据分析解决方案

 目 录 1 摘要 ....................................................................................................................................................................................................................... 1

 2 需求分析与建设目标 ..................................................................................................................................................................................................... 2 3 解决方案 ............................................................................................................................................................................................................... 4

 3.1

 存储技术分析. .............................................................................................. 4 3.1.1

 块存储、文件存储、对象存储几种方式的对比 ............................................................... 4 3.1.2

 对象存储简介 ........................................................................................... 8 3.1.3

 对象存储选型对比 ....................................................................................... 9 3.2

 系统现状. ................................................................................................. 10

 3.3

 IBM GPFS解决方案 .................................................................................. 11

 3.3.1

 GPFS Server集群 ................................................................................ 12

 3.3.2

 GPFS系统基本结构 ............................................................................... 13

 3.3.3

 GPFS系统优势 ................................................................................... 14

 3.3.4

 GPFS典型配置举例 ............................................................................... 15

 3.4

 IBM Cleversafe对象存储解决方案 ............................................................................ 15 3.4.1

 IBM Cleversafe对象存储 .............................................................................. 16

 3.4.2

 IBM Cleversafe对象存储与传统存储高可用性对比 .......................................................... 17 3.4.3

 IBM Cleversafe对象存储纠删(擦除)码技术 .............................................................. 18 3.4.4

 IBM Cleversafe对象存储软硬件配置 ...................................................................... 19 3.4.5

 IBM Cleversafe对象存储扩容 ............................................................................ 21 3.4.6

 Cleversafe对象存储实现PACS系统的灾备建设 .............................................................. 21

 3.5

 大数据分析 ............................................................................................. 22

 4 总结 ......................................................................................................................................................................................................... 24

 采用Cleversafe对象存储技术的新架构用户取得的收益 ............................................................. 25 I

  1 摘要 某市医院(以下简称医院)是集医疗、教学、科研、预防为一体的现代化国家三级甲等综合医院。医院现有A、B、C三个主体院区,编制床位1500张,开放病床3000

  张。在领导班子的带领下,医院全面实施 “ 数字化医院 ” 建设,首创医疗质量管理信息系统、建立城乡协同医疗服务网络。医院作为某市的龙头医

 院,其整体业务呈现快速增长的态势,当前医院正在扩建新的住院病区,随着住院床位数的增加,医院的业务必然会有一个明显的增长,而医院的存储基础架构已经相对老化,其现有的EMC系列存储已经表现出性能瓶颈,医院当前的核心数据库存在性能不均衡的情况,如果要求应用软件开发商进行软件和数据库性能调优,可能需要花费大量人力物力,但却不能保证调优的效果。医院业务量的增涨带来了数据量的增张,PACS系统海量的非结构化数据安全高效的存储是目前亟需解决的问题,在做好非结构化数据存储的基础上,结合结构化数据存储与Apache Spark数据分析处理引擎对接实现临床操作和研发两个方向的大数据分析,从而更好的服务于病人并且促进医疗行业从业人员专业技能的提升,实现数字化医院为全民健康奠定基础。

 综合比较不同的传统存储技术与云存储技术后,选择IBMGPFS+Cleversafe对象存储实现了PACS系统

 海量的非结构化数据的存储和容灾备份。

  2 需求分析与建设目标 医院的核心业务系统是医院数据交换平台(包括 PACS 系统、HIS 系统、 RIS 系统、 LIS 系统等)。

 该系统具有以下特点:

 负载特点:业务峰值在每日上午9点至11点,并发用户的访问量要求高,每天不定时存在大数据量分析负载,但产生分析负载的用户数量不多。月末统计数据量增大,需要产生大量数据报表。

 数据特点:每天新增数据量 500G,数据类型复杂,有数字、文字等结构化的数据占总数据量 31%, 还有大量的图像和影像等非结构化的数据占总数据量 69%。

  系统痛点:

  1.

 医院数据交换平台用于汇总医院各类信息应用系统数据,子应用程序接口复杂,数据量大,需要保证业务科室的访问速度,对系统的稳定性要求极高。

 2.

 原有的NAS系统已经无法满足数据增量的要求,需要提供切实的解决方案,满足未来五年数据增长与业务发展的要求。

 3.

 随着数据量的增加,数据备份的周期在不断增加,已经影响到生产系统的业务响应时间,业务连续性无法得到保障,因此要求提高业务系统的可靠性和可用性,保障业务连续性。

 4.

 随着数据量的增加,新的存储设备不断上线,使运维人员的工作压力越来越大,因此要求解决方案需要降低运维管理的复杂度。

 建设目标:

 医院综合各方面因素,提出了构建医院“大数据云存储”平台的建设目标,具体如下:

 1.构建一套安全、稳固的大数据云存储平台,集中统一承载医院所有业务数据; 2.

 为医院数据交换平台提供高性能、稳定可霏,并具有足够弹性的存储平台;

 3.

 为PACS影像类数据提供大量低成本的存储空间并具有足够的扩展能力;

 4.

 未来扩容应该可以基本做到不停机(停机时间在可接受范围内);

 5.

 提高业务系统的可靠性和可用性,实现容灾备份,保障业务连续性。

  3 解决方案 根据用户的需求我公司提出以下解决方案:POWER小型机采用POWER

 VM虚拟化,X86服务器采用VMWARE虚拟化,采用IBM

  SVC对存储资源进行整合,实现存储资源池,提高存储管理和利用效率,满足核心应用系统在交易高峰时段、日终、计息,年节时间段对主机资源和存储资源的需求,建设同城数据中心,两中心通过SVC

 的Hyperswap+MetroMirror实现双活,同时配置第三站点的硬盘级仲裁防止出现脑裂,采用IBM的云管平台实现POWER和X86虚拟资源的统一管理,把金融产品的查询,各种业务的咨询等

 没有任何保密性可言的系统迁到公有云平台。

 3.1 存储技术分析 3.1.1 块存储、文件存储、对象存储几种方式的对比

 块存储指在一个RAID(独立磁盘冗余阵列)集中,一个控制器加入一组磁盘驱动器,然后提供固定大小的RAID块作为LUN(逻辑单元号)的卷。

 接着块存储会采用映射的方式将这几个逻辑盘映射给主机,主机上面的操作系统会识别到有5块硬盘, 但是操作系统是区分不出到底是逻辑还是物理的,它一概就认为只是5块裸的物理硬盘而已,跟直接拿一块物理硬盘挂载到操作系统没有区别的,至少操作系统感知上没有区别。

 此种方式下,操作系统还需要对挂载的裸硬盘进行分区、格式化后,才能使用,与平常主机内置硬盘的方式完全无异。

 优点:

 1.

 这种方式的好处当然是因为通过了Raid与LVM等手段,对数据提供了保护。

 2.

 另外也可以将多块廉价的硬盘组合起来,成为一个大容量的逻辑盘对外提供服务,提高了容量。

 3.

 写入数据的时候,由于是多块磁盘组合出来的逻辑盘,所以几块磁盘可以并行写入的,提升了读写效率。

  4.

 很多时候块存储采用SAN架构组网,传输速率以及封装协议的原因,使得传输速度与读写速率得到提升。

 缺点:

 1.

 采用SAN架构组网时,需要额外为主机购买光纤通道卡,还要买光纤交换机,造价成本高。

 2.

 主机之间的数据无法共享,在服务器不做集群的情况下,块存储裸盘映射给主机,再格式化使用后,对于主机来说相当于本地盘,那么主机A的本地盘根本不能给主机B去使用,无法共享数据。

 3.

 不利于不同操作系统主机间的数据共享:另外一个原因是因为操作系统使用不同的文件系统,格式化完之后,不同文件系统间的数据是共享不了的。例如一台装了

 WIN7/XP,文件系统是FAT32/NTFS, 而Linux是EXT4,EXT4是无法识别NTFS的文件系统的。就像一只NTFS格式的U盘,插进Linux的笔记本, 根本无法识别出来。所以不利于文件共享。

  文件存储:为了克服块存储文件无法共享的问题,所以有了文件存储。文件存储也有软硬一体化的设备,但是其实普通拿一台服务器/笔记本,只要装上合适的操作系统与软件,就可以架设 FTP与NFS 服务了,架上该类服务之后的服务器,就是文件存储的一种了。

 主机A可以直接对文件存储进行文件的上传下载,与块存储不同,主机A是不需要再对文件存储进行格式化的,因为文件管理功能已经由文件存储自己搞定了。

 优点:

 1.

 造价交低:随便一台机器就可以了,另外普通以太网就可以,根本不需要专用的 SAN 网络,所以造价低。

 2.

 方便文件共享:例如主机 A(WIN7,NTFS 文件系统),主机B(Linux,EXT4文件系统),想互拷一部电影,本来不行。加了个主机C(NFS服务器),然后可以先A拷到C,再C拷到B就OK了。

  缺点:

  读写速率低,传输速率慢:以太网,上传下载速度较慢,另外所有读写都要1台服务器里面的硬盘来承担,相比起磁盘阵列动不动就几十上百块硬盘同时读写,速率慢了许多。

 企业级的NAS存储采用RAID技术提升了数据的可靠性和读写速率,同时采用万兆光纤接口提升了网络传输速率,适合于中小规模的医院用于PACS系统非结构化数据的存取,当数据量达到PB级别时NAS机头 会出现瓶颈。下图是块存储与文件存储的对比图:

 对象存储:内置大容量硬盘的分布式服务器是对象存储的典型设备,对象存储最常用的方案,就是多台服务器内置大容量硬盘,再装上对象存储软件,然后再额外配置几台服务作为管理节点,安装上对象存储管理软件。管理节点可以管理其他服务器对外提供读写访问功能。

 之所以出现了对象存储这种东西,是为了克服块存储与文件存储各自的缺点,发扬它俩各自的优点。简单来说块存储读写快,不利于共享,文件存储读写慢,利于共享。能否实现即读写快又利于共享的目的呢?于是就有了对象存储。

  首先,一个文件包含了属性(术语叫 metadata,元数据,例如该文件的大小、修改时间、存储路径等)以及内容(以下简称数据)。

 以往像 FAT32 这种文件系统,是直接将一份文件的数据与metadata一起存储的,存储过程先将文件按照文件系统的最小块大小来打散(如4M的文件,假设文件系统要求一个块4K,那么就将文件打散成为1000个小块),再写进硬盘里面,过程中没有区分数据/metadata的。而每个块最后会告知你下一个要读取的块的地址,然后一直这样顺序地按图索骥,最后完成整份文件的所有块的读取。

 这种情况下读写速率很慢,因为就算你有100个机械手臂在读写,但是由于你只有读取到第一个块, 才能知道下一个块在哪里,其实相当于只能有1个机械手臂在实际工作。

 而对象存储则将元数据独立了出来,控制节点叫元数据服务器(服务器+对象存储管理软件),里面主要负责存储对象的属性(主要是对象的数据被打散存放到了那几台分布式服务器中的信息),而其他负责存储数据的分布式服务器叫做OSD,主要负责存储文件的数据部分。当用户访问对象,会先访问元数据服务器,元数据服务器只负责反馈对象存储在哪些OSD,假设反馈文件A存储在B、C、D三台OSD,那么

  用户就会再次直接访问3台OSD服务器去读取数据。

 这时候由于是3台OSD同时对外传输数据,所以传输的速度就加快了。当OSD服务器数量越多,这种 读写速度的提升就越大,通过此种方式,实现了读写快的目的。

 另一方面,对象存储软件是有专门的文件系统的,所以OSD对外又相当于文件服务器,那么就不存在文件共享方面的困难了,也解决了文件共享方面的问题。

 所以对象存储的出现,很好地结合了块存储与文件存储的优点。

 为什么对象存储兼具块存储与文件存储的好处,还要使用块存储或文件存储呢?

 1.

 有一类应用是需要存储直接裸盘映射的,例如数据库。因为数据库需要存储裸盘映射给自己后, 再根...

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